内部监督作为医院内部控制的基本要素之一，其主要职能就是对内部控制的建立与实施情况进行监督检查，评价内部控制的完整性、合理性和有效性，发现内部控制缺陷并及时加以改进，它是内部控制体系持续有效运行的重要保证。
（1）明确内部监督的机构及职责。可以成立专门的内部监督机构，也可以授权内部审计机构或其他机构承担内部控制监管职能。由于内部控制是一个从上到下全员参与的过程，医院内部任何一个机构甚至个人都应当在内部控制建立与实施中承担起相应的监督职责。
（2）规范内部控制的评价。医院内部控制的评价要关注诊疗服务流程的设置、医疗服务收费的规范、人均医疗费用的增长以及医德医风的考核，等等，及时发现内部控制的缺陷，采取相应的办法深挖潜在的内部控制缺陷，不留盲区和死角。
（3）充分利用评价信息进行整改。内部控制有效性评价后，应及时将评价信息汇总到医院内部监督机构，经过整理再反馈到医院管理层进行分析，管理层根据分析结果确定改进和完善的内容，制定相应的整改计划和措施并尽快实施，尽可能降低风险和损失。
医院内部控制包括上述5个相互关联的构成要素，一个构成要素不仅仅影响上一个构成要素或下一个构成要素，而是几乎任何一个构成要素都会作用于其他构成要素，尽管每一个构成要素发挥的作用不一样，但它们之间存在着协同和联系，共同形成一个整合的体系，内部控制就是这些构成要素彼此作用的一个多方向的往复过程。构成要素作用机制如图6所示。
