医院作为提供基本医疗服务的非营利性医疗机构，内部控制要素的内涵有其特殊性。构成要素与内部控制目标有直接的关系，并服务于内部控制目标，这些构成要素相互协同和联系，形成一个整合的体系并被“嵌入”（buildingin）医院的整体构架，融合到医院的管理当中而不是简单地“附加”（addingon）于其上。
优化内部环境
（1）以法人化为方向优化组织架构。当前，医院管理体制大都沿袭计划经济模式，政府宏观监管与医院内部管理边界不清，医院缺乏自主权和独立性。医院内部治理外部化、外部治理内部化等体制性矛盾的主要根源是管办不分、政事不分。因此，必须着手建立现代医院法人治理结构，即“理事会﹢监事会﹢院长负责制”，让医院与卫生行政部门脱离行政隶属关系，实现从“行政化”向“法人化”的转型。
（2）以专业化为重点调整人力资源政策。医疗卫生服务的不确定性和个体差异较大，对医务人员专业技术和经验积累依赖性较强，因此，专业性是医院根本的属性。对医务人员而言，单纯强调道德约束和经济激励很难同时保证其公益性与积极性，他们更希望通过医疗服务技术的提高而不是开大处方来获得应有的合法报酬。因此，要从推行“多点执业”、落实职称评定自主权、“去编制化”、完善绩效考核机制等方面来保障医务人员的社会价值与市场价值，使其成为医院改革的重要动力。
（3）以社会责任为导向强化医院文化建设。首先，医院文化要体现社会责任，以良好的医德医风和精湛的技术为患者提供安全、有效、方便、价廉的医疗服务；其次，医院文化要有约束和规范作用，除了制度上的硬约束外，医院自身长期形成的价值观和道德观等软约束对医务人员思想和行为的规范具有不可替代的作用；第三，医院文化能够增强凝聚力，使全院职工产生观念上的认同感和实现医院目标的使命感。
