6种补偿模型都明确了政府和医疗保险的补偿范围，充分发挥医院公益性，破除“以药养医”机制，避免出现过度医疗，促进有限医疗资源合理利用，减轻医疗服务需方的经济负担，切实解决了“看病贵”问题[5]。但是部分补偿模型也对政府和医疗保险部门提出了新的要求，如大幅增加投入、完善医院管理机制和医疗保险机制等。
在补偿模型一中，医院为政府纯财政补偿，医院必须严格执行政府及卫生部分的相关规定，有利于控制医疗费用，有利于基本医疗服务提供的公平性和可及性，发挥医院公益性，为政府和医院自身树立良好的社会形象。但是国际上部分国家实行政府全额投入，保证了医疗服务的全民覆盖，却造成医疗服务效率低下，患者选择性很差，需要很长时间等待才可能得到住院医治。
同时政府全额补偿在保障了医院公益性的基础上，带来了医疗服务需方（患者）的合理需求释放，但是也会随之带来部分不合理需求，造成资源浪费。所以，必须依靠充足的政府财政补偿，改变现有医院管理体制和绩效考核方案，调动医疗卫生工作者的工作积极性，保障医院运行效率。并且政府可以根据自身财政收入情况，选择少数医院进行政府全额补偿，放弃部分医院。
在补偿模型二中，医疗保险转移支付补偿医院，在该补偿模式下，医疗保险部门可以利用医疗保险制度对医院进行管理和约束，科学、合理的医疗保险制度可以有效减轻患者负担，同时促进资源合理利用，医疗保险部门对医院进行管理，有利于形成医院“管办分开”的良好管理模式。
模型二对于医疗保险制度要求较高，可能导致医院会通过开展和增加非医保项目来创收，将负担转嫁到病人一方，将引起更为严峻的过度医疗、医疗资源浪费等问题。所以，政府和医保部分可以根据地方实际情况，加强医疗保险部门对医院的管理，医疗保险部门可以通过提高准入标准，放弃部分医保定点医院，只选择部分医院作为医疗定点单位。集中人力、财力、物力控制医保定点单位运营，保证医院的公益性。加强医院管理，改变筹资和补偿方案以及支付方式。同时，可以拓宽医疗保险筹资渠道，吸纳商业医疗保险参与。
在补偿模型三中，政府补偿医院总成本，明确划分政府财政和医疗保险转移支付补偿的范围和补偿额度，使政府和医疗保险部门的监管更加有效，保证了医院医务工作者的薪酬等运营成本，而其他业务开支由医疗保险转移支付补偿。医院管理者能够在保证总收入不变的基础上，从总量上对固定成本进行限制，控制医院成本，避免对医院产生过度扩张的激励，有利于控制医院开支和医疗费用过快上涨。
在补偿模型四中，正常补偿基本医疗所有病种的开支，医疗保险转移支付其他部分。在我国，县级医院的主要职能应为保证基层群众医疗健康，解决常见病和多发病，加强对危重急症的抢救和转诊，减少病人的致死率。补偿模型四保证了县级医院的功能定位，更好地落实了“保基本、强基层、建机制”的医改工作重心，促进了城乡居民的基本医疗卫生制度的建设，提高了诊疗技术水平和全民健康水平，基本实现大病不出县，促进人人享有基本医疗卫生服务目标实现。所以，针对模型四可以结合地区情况，不断扩大基本医疗覆盖面，改变医疗保险补偿方案，降低起付线，提高补偿标准，并鼓励医院改变支付方式，节省医疗资源，力争结余。
补偿模型五和模型六在补偿模型三和模型四的基础上，考虑需求释放、物价指数、业务发展等因素对医院运行的影响，符合实际情况和现实要求。但是影响医院运行的因素复杂且具有不稳定性，难以准确估算。
